To ten twój raster to jakiś zwykły obrazek? Bez "swojego miejsca w świecie"? Bo już się pogubiłem. Przetestuj to sobie może, na jakimś innym rastrze. Proponuję żebyś zrobił to krok po kroku na załączonym rastrze.
Pobierz oba pliki do tego samego katalogu, zmień nazwę pliku raster.txt na raster.pngw, otwórz QGIS, ustaw układ projektu na PL 92, wczytaj pobrany raster (sprawdź we właściwości > ogólne czy wczytał się w układzie PL 92, jak nie to zmień), zapisz go w układzie PL 92 jako geotiff (Raster > Konwersja > Konwertuj raster), wczytaj nowy raster, stwórz szejpa w PL 92 i zrób poligon, wykadruj.
Zadziałało? Pewnie tak. No, to teraz zapisz w taki sam sposób swojego rastra i powtórz na nim wszystkie kroki